Savoir
Au terme de cette unité d'enseignement, l'étudiant sera capable de maîtriser les concepts théoriques suivants :
- Rappel des molécules biochimiques fondamentales :
- acides aminés
- peptides
- protéines
- enzymes
- acides nucléiques
- Techniques d'utilisation générale en biotechnologie :
- Electrophorèse
- Southern Blot
- PCR
- Clonage
- Modification génétique
- Applications de la biotechnologie en environnement
- Les pesticides
Savoir faire
Au terme de cette unité d'enseignement, l'étudiant sera capable de connaître la structure des principaux composés (acides aminés, peptides, protéines, enzymes et acides nucléiques). Savoir faire le lien avec le cours de biologie et de biochimie. Comprendre les méthodes de biologie moléculaire. Savoir expliquer les techniques les plus couramment utilisées en biotechnologie.
Savoir être
L'étudiant doit faire preuve d'esprit critique et de rigueur.
Savoir
Au terme de cette unité d'enseignement, l'étudiant sera capable de maîtriser les concepts théoriques suivants :
Généralités
Matériel nécessaire
Contenu
Objectifs
Evaluation
- Evaluation du travail en classe
- Cahier de laboratoire
- Dessins
- Interrogations
Règles de sécurité et d'hygiène au laboratoire de microbiologie
Théorie : Rappel sur le microscope
Manipulation du microscope et mesure de la taille des micro-organismes
Le microscope optique : description
Le microscope optique : mode d'emploi
Le microscope : Précautions d'usage
Microscope : Mesure de la taille des cellules
Observation et mesure de micro-organismes
- Observation d'une levure
- Observation d'un bouillon de culture de foin
Coloration de Gram
Principe de la coloration de Gram
Observation de frottis de yaourt colorés par la méthode de GRAM
Frottis de prélèvement buccopharyngé
Préparation d'eau physiologique stérile
Préparation de milieux de culture
Composition de quelques milieux courants
Mise en culture de bactéries
Travail en milieu aseptique
- Stérilisation d'un oese
- Ensemencement des boîtes de Pétri
- Mise en culture
- Aspect et formes des colonies
- Manipulation : comparaison de milieux de cultures
Présence de micro-organismes dans l'environnement : le laboratoire
Dénombrement des bactéries dans un échantillon de sol
But
Prélèvement et préparation d'un échantillon de sol
Stérilisation dans une marmite à pression
Stérilisation à la flamme
Préparation d'une série de suspensions - dilutions de sol
Méthode d'ensemencement d'un milieu de culture liquide avec des suspensions - dilutions de sol
- Ensemencement d'un milieu liquide
Calcul du nombre le plus probable de micro-organismes par la methode de Mc Crady
- Détermination du nombre caractéristique
- Détermination du nombre le plus probable de micro-organismes
Méthode d'ensemencement d'un milieu de culture solide avec des suspensions - dilutions de sol
Cycle de l'azote
Introduction
Mise en évidence de la décomposition des protéines et numération des micro-organismes protéolytiques
- Introduction et but
- Principe
- Mode opératoire
- Résultats
Fixation aérobie d'azote atmosphérique par les micro-organismes libres du sol. Numération des bactéries du genre azotobacter
- But
- Principe
- Mode opératoire
Mise en évidence de la nitrification
- But
- Rappel
- Principe
- Mode opératoire
Savoir faire
Au terme de cette unité d'enseignement, l'étudiant sera également capable de réaliser les manipulations demandées avec ordre et méthode en respectant les modes opératoires, les régles de sécurité et en utilisant de manière correcte le matriel scientifique mis à disposition. Comprendre, à partir de manipulations, le principe de certaines techniques microbiologiques de laboratoire. Prolonger l'acquisition du savoir-faire de base d'un chimiste de laboratoire. Présenter et rédiger des rapports (cahier de laboratoire) clairs, précis et concis concernant les observations en mentionant les conclusions qu'il a déduit des manipulations et comme préparation à la rédaction du travail de fin d'études. Savoir expliquer les connaissances acquises dans le cours de microbiologie théorie.
Savoir être
L'étudiant doit faire preuve de dextérité manuelle, ordre, propreté, d'esprit critique et de rigueur.
L'étudiant doit organiser et planifier son travail dans le respect des modes opératoires et du matériel mis à sa disposition.
Travailler tant en autonomie qu'en équipe.
Savoir
Au terme de cette unité d'enseignement, l'étudiant sera capable de maîtriser les concepts théoriques suivants :
- Rappels sur la microbiologie générale
- Etudes des techniques utilisées en microbiologie
- Notions de microbiologie environnementale
Savoir faire
Au terme de cette unité d'enseignement, l'étudiant sera également capable de savoir expliquer la structure, le métabolisme, le mode de nutrition des bactéries. Savoir différencier les types de micro-organismes. Savoir expliquer les techniques les plus couramment utilisées en microbiologie pour l'observation, la culture, l'identification et l'élimination des micro-organismes et faire le lien avec le laboratoire. Connaître le rôle des principaux micro-organismes présents dans l'environnement étudiés au cours.
Savoir être
L'étudiant doit faire preuve d'esprit critique et de rigueur.